Добрый день. Точно такая же проблема: при импорте товар падает в корень инфоблока. Если же снять галочку "При выгрузке учитывать тип инфоблока" - создается новый инфоблок, в ктором нормально создается категория и в нее складываются товары. Поиском решения проблемы найти не смогли. Заранее благодарю за помощь.