Решил поделиться возможным решением.
(для тех кому лень читать, смотрите то что жирным написано)
Моя ситуация была такой:
2022 год. Редакция Малый Бизнес + 1с УТ 10.3. Настройка обмена дерева групп пустая (выгружается как есть в 1с из отобранных товаров).
Создан новый сайт, запущен в работу, менеджеры обучены и выгружают/загружают товары.
Примерно 4 месяца никаких проблем. Тут звонок и мол "А у нас новая коллекция товаров заведена в 1С, выгружаем, а папок новых на сайте нет."
Подключаюсь, смотрю - и правда не появляются. Пробовал даже старые товары в новый раздел переместит (а мало ли). И кучу других вариантов перепробовал - никак. Сами товары появляются в корне инфоблока и все с товарами хорошо (заполненная информация правильно передалась), цена устанавливались и доступное количество товара как в 1с, на складе также.
В логах ошибка (как тут писали ранее): "Произошла ошибка на стороне сервера. Ответ сервера: failure. Ошибка импорта метаданных.Количество импортированных складов превышает разрешённое для данной редакции." Причем в выгрузке настроено, чтобы использовался только один склад и поэтому сначала я на эту ошибку не обращал внимания. Когда совсем идеи закончились нашел эту тему. Попробовал то что тут советовали (но почти все и так было сделано, а остальная малая часть ответов ну как-то совсем не для решения проблемы).
В общем ответа в теме не нашел. Полез копаться в 1с и Битриксе дальше. И совершенно случайно зашел в Магазин - Складской учет - Склады. С удивлением увидел новый! второй! склад (напоминаю, редакция Малый Битрикс, где только один склад разрешен). И причем этот склад был создан "сегодняшним" днем (таким образом был создан в момент обмена) и почему-то стал "по-умолчанию".
Сначала решил его оставить (ну мало ли пригодится или работать с ним можно будет) и лишь вернул "по-умолчанию" первому нужному складу. Не помогло. Ошибка в логах оставалась и никаких изменений нужных мне не было. Сделал копию сайта и удалил нафиг второй склад. И о чудо, все штатно заработало, все товары новые разлетелись по новым разделам. Хэппи энд.