Не могу найти, а ориентироваться на существующую реализацию обмена в конкретном экземпляре 1С не могу (никогда не слышал о чистой конфигурации, часто люди доводят имеющуюся до "последней").
Знаю что давно можно указать какая группа номенклатуры пойдет в какой каталог на сайте.
Меня же интересует возможность настроить соответствие групп на сайте и групп в 1С. Да так, чтобы одна группа на сайте могла соответствовать двум и более группам в 1С. Толи у меня дежавю, толи и правда такая возможность есть, а я не могу найти о ней ничего.
Если на сайте иерархия папок должна быть отличная от 1С, то необходимо использовать функционал дерева групп, который задается в настройках обмена(в табличной части на вкладке товаров).